מסננים מגנטיים מורכבים מחומרים מגנטיים חזקים ומסך מסנן מחסום. יש להם פי עשרה מכוח ההדבקה של חומרים מגנטיים כלליים והם מסוגלים לספוג מזהמים פרומגנטיים בגודל מיקרומטר בהשפעה מיידית של זרימת נוזל או במצב קצב זרימה גבוה. כאשר זיהומים פרומגנטיים בתווך ההידראולי עוברים דרך הרווח בין טבעות הברזל, הם נספגים אל טבעות הברזל, ובכך משיגים את אפקט הסינון.